經(jīng)診斷患有心力衰竭、中風(fēng)、不孕癥和腎衰竭的患者實際上可能患有一種罕見的未確診的遺傳疾病。如今，在一項新的研究中，來自美國范德堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員開發(fā)出一種新的方法：在電子病歷中搜索遺傳數(shù)據(jù)以便在大量人群中鑒定出這種遺傳疾病，這樣就可根據(jù)疾病的實際原因量身定制治療方案。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2018年3月16日的Science期刊上，論文標題為“Phenotype risk scores identify patients with unrecognized Mendelian disease patterns”。論文通信作者為范德堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院精準醫(yī)學(xué)中心主任、生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)教授和醫(yī)學(xué)教授Josh Denny博士。論文第一作者為范德堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Lisa Bastarache。

這種由Denny、Bastarache和他們的合作者們開發(fā)的新方法產(chǎn)生表型風(fēng)險分數(shù)（phenotype risk score），從而發(fā)現(xiàn)可能由遺傳變異--包括一些之前不為人所知的遺傳變異---導(dǎo)致的癥狀模式。

這些研究人員推斷當前經(jīng)診斷患上心力衰竭、中風(fēng)、不孕或腎衰竭等疾病的許多患者實際上可能患有一種罕見的遺傳疾病。如果這種遺傳疾病能夠被鑒定出，那么就可能進行針對性的治療來阻止癥狀復(fù)發(fā)或惡化。

通過將傳統(tǒng)資源與更新的數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)相結(jié)合，這些研究人員根據(jù)21701人的癥狀清單與1204種不同的遺傳疾病的吻合情況給這些人分配表型風(fēng)險分數(shù)。對存在高度匹配的個人而言，由此產(chǎn)生的表型風(fēng)險分數(shù)是比較高的，而對于缺乏疾病關(guān)鍵特征的個人而言，由此產(chǎn)生的表型風(fēng)險分數(shù)是比較低的。

這些研究人員發(fā)現(xiàn)遺傳變異與較高的表型風(fēng)險分數(shù)之間存在的18種關(guān)聯(lián)性。一些關(guān)聯(lián)性是遺傳學(xué)家廣為所知的，比如導(dǎo)致囊性纖維化的兩種遺傳變異，但大多數(shù)關(guān)聯(lián)性是針對之前未曾描述的遺傳變異。

Bastarache說，“表型風(fēng)險分數(shù)能夠容易地應(yīng)用于任何與DNA相關(guān)的電子病歷系統(tǒng)中。我們的研究僅涉及人類基因組的一小部分樣本，大約有6000種遺傳變異。利用這種方法取得更多發(fā)現(xiàn)的幾率是非常大的。”