在一項新的研究中,來自日本東京大學的研究人員通過利用計算機圖像分析和現(xiàn)代的電子顯微鏡成像揭示了一種至關(guān)重要的稱為免疫球蛋白M(IgM)的免疫蛋白的結(jié)構(gòu),從而為未來開發(fā)出針對從癌癥到神經(jīng)系統(tǒng)疾病的一系列疾病的更加有效的藥物提供了可能性。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2018年10月10日的Science Advances期刊上,論文標題為“The IgM pentamer is an asymmetric pentagon with an open groove that binds the AIM protein”。論文通信作者為東京大學的Toru Miyazaki和Satoko Arai。
圖片來自Science Advances, doi:10.1126/sciadv.aau1199。
IgM是免疫系統(tǒng)的一個重要的組成部分。這些研究人員利用IgM的人類版本和小鼠版本對天然的IgM的結(jié)構(gòu)進行了驗證。他們認為IgM如今應當被理解為形狀像不完整的六邊形,或者像是有楔形缺口的五邊形。Miyazaki說,“我們將不得不改寫教科書。”
IgM是首個在人類胎兒中產(chǎn)生的免疫系統(tǒng)蛋白,并且在一生當中始終首先對病原體入侵作出反應的蛋白分子。 IgM的結(jié)構(gòu)于1969年首次被確定為“五角星形狀的桌子(five-pointed, star-shaped table)”,并于2009年更新為五面圓頂(five-sided dome)或“蘑菇形帽(mushroom cap)”。
Miyazaki說,“最初的IgM結(jié)構(gòu)模型是通過低分辨率的顯微鏡觀察幾個IgM分子構(gòu)建出來的。如今,我們有了更清晰的圖片,而且計算機能夠研究成千上萬個IgM分子。”當Miyazaki當初還是一名醫(yī)學博士時,他的研究生涯就研究了一種不同的稱為巨噬細胞凋亡抑制因子(apoptosis inhibitor of macrophage, AIM)的蛋白。
由于確定了IgM的正確形狀,這些研究人員如今了解到?jīng)]有活性的AIM位于IgM的不完整六邊形的空隙內(nèi)。IgM和AIM之間的結(jié)構(gòu)關(guān)聯(lián)性意味著具有調(diào)節(jié)AIM釋放能力的藥物可能被用來開發(fā)基于AIM的疾病治療方法。當其他的分子激活免疫系統(tǒng)時,IgM會釋放AIM。尺寸較小的AIM蛋白在體內(nèi)循環(huán),以便清除受損的細胞和阻止疾病產(chǎn)生。
1999年,Miyazaki在瑞士巴塞爾免疫學研究所工作時就已鑒定出AIM。它的小尺寸意味著AIM很容易通過腎臟從體內(nèi)排出并進入尿液中,因此與較大的IgM結(jié)合在一起可保護AIM在需要之前不被清除。
AIM是血液中的一種常見的分子,但是它僅在身體發(fā)病時才是有活性的。已知AIM在預防肥胖、脂肪肝疾病、肝細胞癌、多發(fā)性硬化癥、真菌誘導性腹膜炎和急性腎損傷中起著重要的作用。
這種不完整的六邊形結(jié)構(gòu)仍然只是對IgM結(jié)構(gòu)的二維理解。Miyazaki和他的團隊繼續(xù)開展進一步的分析,并希望盡快地報道IgM的三維結(jié)構(gòu)。
參考資料:
E. Hiramoto, A. Tsutsumi, R. Suzuki et al. The IgM pentamer is an asymmetric pentagon with an open groove that binds the AIM protein. Science Advances 4: eaau1199 (2018), doi:10.1126/sciadv.aau1199.
A. FEINSTEIN et al. Conformation of the Free and Antigen-bound IgM Antibody Molecules, Nature (2006). DOI: 10.1038/2241307a0
D. M. Czajkowsky et al. The human IgM pentamer is a mushroom-shaped molecule with a flexural bias, Proceedings of the National Academy of Sciences (2009). DOI: 10.1073/pnas.0903805106
原標題:Science子刊:改寫教科書!重新確定抗體IgM的結(jié)
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