最近發(fā)表在Nature Genetics上的最全面的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)結(jié)果發(fā)現(xiàn)了40種新的與結(jié)腸癌的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)的遺傳變異。
由Fred Hutchinson癌癥研究中心的一個(gè)研究小組領(lǐng)導(dǎo)的這項(xiàng)研究同時(shí)確定了第一種罕見(jiàn)的散發(fā)性結(jié)直腸癌保種。總之,這些發(fā)現(xiàn)對(duì)于創(chuàng)建個(gè)性化篩查策略和更好地為結(jié)直腸癌的藥物開(kāi)發(fā)提供了重要的信息。
這些研究結(jié)果也闡明了研究作者在藥物開(kāi)發(fā)中所謂的“錯(cuò)失機(jī)會(huì)”。作者認(rèn)為,使用GWAS結(jié)果為癌癥藥物開(kāi)發(fā)提供信息可以提高藥物開(kāi)發(fā)成功率,甚至可以為高風(fēng)險(xiǎn)人群提供化學(xué)預(yù)防藥物。
(Wikipedia/CC BY-SA 3.0)
“使用GWAS結(jié)果為抗癌藥物的靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)提供了很大的潛力。對(duì)于2型糖尿病和心臟病等疾病,GWAS方法推動(dòng)了新生物學(xué)和潛在藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn),”該研究的作者,Jeroen Huyghe博士解釋說(shuō):“迄今為止,對(duì)癌癥治療新目標(biāo)的研究主要集中在癌癥細(xì)胞的分子特征上。我們認(rèn)為使用GWAS方法為結(jié)直腸癌的藥物開(kāi)發(fā)提供了一個(gè)巨大的機(jī)會(huì)。”
Huyghe解釋說(shuō):“大規(guī)模的全基因組測(cè)序研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)百種尚未系統(tǒng)檢查與疾病相關(guān)的遺傳變異。我們的研究充分利用了Haplotype Reference Consortium面板的可用性,該面板是來(lái)自超過(guò)32,000個(gè)個(gè)體的序列數(shù)據(jù)的群體參考面板。通過(guò)將該策略與定制設(shè)計(jì)的基因分型芯片相結(jié)合,我們能夠穩(wěn)健地識(shí)別罕見(jiàn)的變異關(guān)聯(lián)信號(hào)以及涉及低頻變種的多個(gè)附加信號(hào)。“
之前針對(duì)結(jié)直腸癌風(fēng)險(xiǎn)的GWAS僅考察了常見(jiàn)的遺傳變異。相比之下,這項(xiàng)研究涉及超過(guò)2,000個(gè)人的全基因組測(cè)序,旨在檢查罕見(jiàn)遺傳變異對(duì)結(jié)直腸癌風(fēng)險(xiǎn)的貢獻(xiàn)。
“通過(guò)這項(xiàng)研究,我們已經(jīng)將已知數(shù)量的結(jié)直腸癌風(fēng)險(xiǎn)變種帶到了近100個(gè),”該研究的共同第一作者,F(xiàn)red Hutch的遺傳流行病學(xué)家Tabitha Harrison說(shuō)。 “接下來(lái),我們將研究人群擴(kuò)大到包括來(lái)自不同種族背景的人。這將使我們更全面地了解整個(gè)人口的風(fēng)險(xiǎn)。”
資訊出處:Study discovers 40 new genetic variants associated with colorectal cancer risk
原始出處:Jeroen R. Huyghe et al, Discovery of common and rare genetic risk variants for colorectal cancer, Nature Genetics (2018). DOI: 10.1038/s41588-018-0286-6
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