近日,一項(xiàng)刊登在國際雜志Nature Nanotechnology上的研究報(bào)告中,來自麥吉爾大學(xué)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種新技術(shù),其能對(duì)單一樣本中成百上千種蛋白質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),該技術(shù)未來有望作為醫(yī)院和研究性實(shí)驗(yàn)室快速、高容量及高性價(jià)比的工具進(jìn)行使用。
圖片來源:insight.mrc.ac.uk
血液中的蛋白質(zhì)能為研究者和臨床醫(yī)生提供指示機(jī)體健康的關(guān)鍵信息,這些生物性標(biāo)志物還能確定患者的胸痛是由心血管疾病事件引起或是患者患癌所誘發(fā)的。很不幸的是,盡管我們機(jī)體中有超過2萬種蛋白質(zhì),但在過去50年里用來檢測(cè)這些蛋白質(zhì)的工具并沒有改進(jìn)多少。而且當(dāng)前絕大多數(shù)的蛋白質(zhì)檢測(cè)技術(shù)只能針對(duì)一種蛋白質(zhì)。
這項(xiàng)研究中,研究人員開發(fā)了一種新技術(shù),該技術(shù)能對(duì)單一血液樣本中成百上千種蛋白質(zhì)進(jìn)行檢測(cè);此前研究者利用多色熒光染料開發(fā)出了一種新型改進(jìn)版的微珠條形碼技術(shù),通過產(chǎn)生多達(dá)500種不同顏色的微珠,該條形碼平臺(tái)就能對(duì)樣本中的多種標(biāo)志物進(jìn)行檢測(cè),比如藍(lán)色條形碼能檢測(cè)標(biāo)志物1,紅色條形碼能檢測(cè)標(biāo)志物2(以此類推),隨后基于激光的細(xì)胞計(jì)數(shù)器就能對(duì)吸附不同顏色微珠的蛋白質(zhì)進(jìn)行計(jì)數(shù)。
雖然這種分析方法已經(jīng)被開發(fā)了一段時(shí)間了,但是多色染料之間的干擾常常會(huì)限制正確顏色的產(chǎn)生;在這項(xiàng)最新研究中,研究人員設(shè)計(jì)了一種新算法,其能使不同顏色的微珠以較高的準(zhǔn)確率產(chǎn)生,就好像一個(gè)比色轉(zhuǎn)盤一樣能夠預(yù)測(cè)顏色混合的結(jié)果。研究者Juncker表示,我們希望能夠利用該平臺(tái)來改善后期對(duì)多種不同蛋白質(zhì)的分析。
當(dāng)前的技術(shù)在一次能夠測(cè)定的蛋白質(zhì)數(shù)量、測(cè)試的成本和準(zhǔn)確率之間能夠權(quán)衡利弊,這就意味著,在諸如臨床試驗(yàn)等大規(guī)模的研究中,其或許會(huì)表現(xiàn)出動(dòng)力不足的狀態(tài),因?yàn)楫?dāng)前的技術(shù)往往依賴于功能有限的可靠平臺(tái)。最后研究者表示,后期他們工作的重點(diǎn)將是通過增加規(guī)模來保持對(duì)蛋白質(zhì)的準(zhǔn)確檢測(cè)。
原始出處:Milad Dagher, Michael Kleinman, Andy Ng, et al. Ensemble multicolour FRET model enables barcoding at extreme FRET levels. Nature Nanotechnology, 2018; DOI: 10.1038/s41565-018-0205-0
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