對脫落到患者血液循環(huán)中的腫瘤DNA進行分析可提供一種檢測腫瘤存在并分析它的DNA是否發(fā)生可靶向突變的非侵入性方法。對循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）進行縱向分析有望監(jiān)測治療反應。

不幸的是，檢測血液中少量腫瘤DNA是較為困難的，特別是在已接受初始化療的非轉移性癌癥患者中。在這些患者中，在治療期間或在治療完成之后，當前的大多數(shù)方法對殘留疾病的檢測缺乏足夠的靈敏度。

在一項新的研究中，為了解決這個問題和改進對血漿中微量殘留腫瘤DNA的檢測靈敏度，來自美國亞利桑那州菲尼克斯市轉化基因組學研究所、亞利桑那州立大學、梅奧診所、希望之城和英國劍橋大學的研究人員開發(fā)出一種稱為靶向數(shù)字測序（targeted digital sequencing, TARDIS）的方法，用于多重分析患者特異性的癌癥突變。在參考樣本中，在使用相當于單管血液的輸入DNA的情形下，通過同時分析8到16個已知突變，TARDIS在突變等位基因分數(shù)（mutant allele fraction）為0.03%和0.003%時分別實現(xiàn)91%和53%的靈敏度，它的檢測特異性為96%。相關研究結果發(fā)表在2019年8月7日的Science Translational Medicine期刊上，論文標題為“Personalized circulating tumor DNA analysis to detect residual disease after neoadjuvant therapy in breast cancer”。

在來自33名患有I期至III期乳腺癌的女性患者的80份血漿樣本中，這些研究人員成功地分析了每名患者多達115個突變。在治療前，TARDIS在所有患者中檢測到ctDNA（中位等位基因分數(shù)為0.11％）。在完成新輔助療法后，與殘留疾病患者相比，實現(xiàn)病情完全緩解的患者的ctDNA濃度較低（中位等位基因分數(shù)分別為0.003％和0.017％，P = 0.0057，AUC = 0.83）。此外，實現(xiàn)病情完全緩解的患者在新輔助治療期間表現(xiàn)出更大的ctDNA濃度下降。

這些結果證實了在新輔助治療期間，使用ctDNA分析評估分子反應和殘留疾病的高準確度。相比于當前在使用臨床相關血容量的情形下達到的ctDNA檢測極限，TARDIS實現(xiàn)高達100倍的改進，這就證實個性化ctDNA跟蹤可能能夠實現(xiàn)對以治療為目的的癌癥患者進行個體化臨床管理。

參考資料：

Bradon R. McDonald et al. Personalized circulating tumor DNA analysis to detect residual disease after neoadjuvant therapy in breast cancer. Science Translational Medicine, 2019, doi:10.1126/scitranslmed.aax7392.

原標題：Science子刊：新型ctDNA血液測試可顯著改善乳腺癌診斷