雖然人類微生物群的結(jié)構(gòu)和功能已經(jīng)得到了廣泛的研究，但對其物種內(nèi)遺傳多樣性的了解卻較少。然而，微生物群的基因突變可以賦予生物醫(yī)學(xué)相關(guān)的特征，如從食物中提取營養(yǎng)物質(zhì)、代謝藥物、躲避抗生素以及與宿主免疫系統(tǒng)進(jìn)行交流的能力。這些性狀進(jìn)化的種群遺傳過程是復(fù)雜的，部分是由于微生物群中的生態(tài)和進(jìn)化力量相互作用。基因組測序的進(jìn)展，加上生物信息學(xué)工具和種群遺傳模型，都有助于量化微生物組遺傳變異，并推斷這種多樣性產(chǎn)生進(jìn)化與宿主性狀的關(guān)聯(lián)。美國加州大學(xué)洛杉磯分校的加魯?shù)碌妊芯咳藛T對影響宿主體內(nèi)和宿主間微生物組遺傳多樣性的種群遺傳力，包括突變、重組、漂移和選擇等進(jìn)行了全面梳理。