2020年的進(jìn)度條走到了50%,新冠病毒(SARS-CoV-2)已在全世界累計感染1000多萬人,造成50多萬人死亡。無疑,我們迫切需要開發(fā)有效的抗病毒療法。
頂尖學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》在線發(fā)表的一篇最新研究論文中,一支國際研究小組通過分析新冠病毒“劫持”細(xì)胞蛋白質(zhì)的具體過程,鑒定出可以抑制病毒活性的多種化合物,而這些化合物過去并不知道它們具有治療COVID-19的希望。鑒于其中有一些已經(jīng)獲得FDA的批準(zhǔn),研究人員建議盡快在臨床試驗中測試這些藥物。
▲這項工作由歐洲分子生物學(xué)實驗室(EMBL)、美國加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)、霍華德·休斯醫(yī)學(xué)研究所(HHMI)、法國巴斯德研究所、德國弗萊堡大學(xué)(University of Freiburg)等機(jī)構(gòu)合作開展
面對這種全新的病毒,盡管在短短半年時間里,人們的認(rèn)識已經(jīng)有了許多突破,然而,我們對它如何利用人體細(xì)胞不斷復(fù)制、并感染更多細(xì)胞的過程,還存在許多未知。
越來越多的研究證據(jù)表明,新冠病毒的傳播有不同于其他同類病毒的特征。如果能搞清楚新冠病毒感染細(xì)胞的更多細(xì)節(jié),就能更有針對性地找到對應(yīng)策略,用于治療新冠疾病。這也正是此次研究工作的重要意義。
我們知道,病毒無法自行復(fù)制,必須靠其他生物(也就是宿主)來攜帶、復(fù)制并擴(kuò)散到新的宿主。在這個過程中,病毒需要操縱宿主細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)機(jī)器,來生產(chǎn)新的病毒顆粒。
研究人員指出,這種“劫持”宿主細(xì)胞的過程涉及一系列酶和其他蛋白質(zhì)的活性變化。“磷酸化”就是一種重要的蛋白質(zhì)活性調(diào)節(jié)方式,在細(xì)胞生長和死亡、細(xì)胞與細(xì)胞的信號交流等過程中扮演關(guān)鍵角色。具體來說,磷酸化指的是被稱為激酶的酶把一個磷酸基團(tuán)加到目標(biāo)蛋白質(zhì)上,改變這種蛋白質(zhì)的活性。
病毒會如何改變細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化模式,用來促進(jìn)自身傳播?為了回答這一點,研究小組使用基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)方法評估被新冠病毒感染后的細(xì)胞,測量宿主蛋白質(zhì)和病毒蛋白的變化。他們發(fā)現(xiàn),與病毒相互作用的細(xì)胞蛋白質(zhì)中,有12%的蛋白質(zhì)發(fā)生了磷酸化的改變。其中,酪蛋白激酶II(CK2)和p38/MAPK信號通路的活化最有可能調(diào)節(jié)這些修飾過程。而這些結(jié)果提示,激酶是阻止病毒活性的潛在藥物靶點。
▲細(xì)胞感染新冠病毒后,活性上升(紅色)和下降(藍(lán)色)的激酶及其信號通路(圖片來源:參考資料[1])
研究發(fā)現(xiàn),在一系列激酶的連鎖作用下,新冠病毒感染導(dǎo)致細(xì)胞停留在細(xì)胞周期的某個節(jié)點。這意味著,“該病毒阻礙了細(xì)胞分裂,為病毒提供了一個相對穩(wěn)定和充裕的環(huán)境持續(xù)復(fù)制。”EMBL小組的負(fù)責(zé)人Pedro Beltrao博士解釋說。
更令人驚訝的一個現(xiàn)象是,新冠病毒不僅影響了細(xì)胞分裂,還會讓受感染的細(xì)胞改變形狀,長出了細(xì)長、分叉的絲狀偽足,它們就像細(xì)胞伸出的許多條“手臂”,幫助病毒“夠”到鄰近的細(xì)胞。研究人員猜測,細(xì)胞的結(jié)構(gòu)變化有助于病毒感染更多細(xì)胞!
▲電鏡下顯示細(xì)胞絲狀偽足上的新冠病毒顆粒(圖片來源:參考資料[2];Credit: Elizabeth Fischer, Microscopy Unit NIH/NIAID)
根據(jù)激酶活性的分析結(jié)果,研究人員們鑒定出了有抗病毒潛力的87種藥物和化合物。“激酶的結(jié)構(gòu)特征使它們成為良好的藥物靶點。” Beltrao教授介紹,“針對我們鑒定出的幾種激酶,已經(jīng)有一些開發(fā)出來的藥物,因此我們認(rèn)為,臨床研究人員可以在試驗中測試這些藥物的抗病毒效果。”
在實驗室初步測試的藥物和化合物中,研究人員發(fā)現(xiàn)其中7種,包括silmitasertib(一款在研小分子抗癌藥)、吉瑞替尼(gilteritinib,已獲批治療白血?。┑劝邢蚣っ傅囊种苿┰趯嶒炛酗@示出了強(qiáng)有力的抗病毒活性。“我們希望在這項工作的基礎(chǔ)上,測試更多激酶抑制劑,同時找出更多可以有效干預(yù)COVID-19的機(jī)制和潛在療法。”UCSF的研究負(fù)責(zé)人Kevan Shokat教授說道。
另一位共同通訊作者Nevan Krogan教授表示:“數(shù)據(jù)驅(qū)動的藥物發(fā)現(xiàn)方法讓我們鑒定出一組新的藥物,單獨使用或是與其他藥物組合使用,有抗擊新冠的巨大潛力。如果這些藥物將終結(jié)疫情,我們會很高興。”
期待科學(xué)家們的努力,讓疫情盡快終結(jié),這也是無數(shù)人對2020年下半年最大的心愿。
參考資料
[1] Mehdi Bouhaddou et al., (2020) Author links open overlay panelThe Global Phosphorylation Landscape of SARS-CoV-2 Infection. Cell. Doi: https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.034
[2] Existing drugs can prevent SARS-CoV-2 from hijacking cells. Retrieved June 30, 2020, from https://www.ebi.ac.uk/about/news/press-releases/existing-drugs-can-prevent-sars-cov-2-hijacking-cells
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