1. 腦脊液壓力增高，外觀多清亮。
2. 腦脊液常規(guī)檢查可見細(xì)胞數(shù)增多，多為(10～500)×106/L，通常<200×106/L，呈淋巴細(xì)胞反應(yīng)，少數(shù)病例以中性粒細(xì)胞為主。也可見少量紅細(xì)胞，偶見數(shù)以千計(jì)的紅細(xì)胞(106/L)或黃變癥，提示出血性病變，多見于單純皰疹病毒性腦炎。腦脊液生化可見蛋白輕、中度增高，但是通常<1g/L，氯化物和糖正常，個(gè)病病例晚期可見糖降低，3%～5%的病例發(fā)病數(shù)日內(nèi)腦脊液常規(guī)生化正常，再次復(fù)查可見異常改變。
3. 腦脊液免疫學(xué)檢查：病毒感染后，機(jī)體通過免疫系統(tǒng)的反應(yīng)產(chǎn)生相關(guān)抗體，通過ELISA法、免疫印跡法和間接免疫熒光等方法可以檢測(cè)到一些病毒的IgM、IgG抗體，如單純皰疹病毒、帶狀皰疹病毒等。
4. 病原學(xué)檢查: 近年來由于測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步，可以采用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)腦脊液中的DNA、RNA病毒進(jìn)行測(cè)序分析，增加了病毒性腦炎病原體的檢出率，如單純皰疹病毒、巨細(xì)胞病毒、EB病毒等。
但是并非所有病毒性腦炎的腦脊液均呈現(xiàn)典型改變，而且二代測(cè)序技術(shù)也存在一定的假陽性和假陰性率，因此目前仍然是在臨床特征、影像學(xué)改變、血和腦脊液化驗(yàn)分析的基礎(chǔ)上，結(jié)合治療反應(yīng)對(duì)病毒性腦炎進(jìn)行臨床診斷。
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