焰火升空,煙花怦然綻放,照亮了黑夜,也照亮觀眾的眼眸。能夠欣賞光在瞬息間的千百般變化,要感謝我們的視網(wǎng)膜。
視網(wǎng)膜上緊湊排列著近百種不同類型的神經(jīng)細(xì)胞,它們連結(jié)成復(fù)雜的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),飛速傳遞信號(hào)和整合信號(hào),讓大腦實(shí)時(shí)感知到眼睛所見的盛景。
在這些視網(wǎng)膜細(xì)胞中,有些成對(duì)存在的神經(jīng)元,其中一個(gè)在光亮增強(qiáng)時(shí)有所反應(yīng),另一個(gè)在光亮減弱時(shí)有所反應(yīng),這樣的設(shè)置對(duì)我們感知光的明暗變化至關(guān)重要。
如同照鏡子一般看起來相同的一對(duì)細(xì)胞卻有著相反的功能,在發(fā)育生物學(xué)家看來,是一個(gè)有趣而難解的謎題。就像有的人在成長(zhǎng)時(shí)遇到一個(gè)“貴人”改變了人生道路,在細(xì)胞發(fā)育的道路上,什么基因會(huì)是決定細(xì)胞命運(yùn)的關(guān)鍵?
權(quán)威學(xué)術(shù)期刊Neuron近期發(fā)表的一篇論文中,哈佛大學(xué)和約翰·霍普金斯大學(xué)的科學(xué)家們合作,采用新的技術(shù)策略,在一類成對(duì)存在的視網(wǎng)膜神經(jīng)細(xì)胞中,找到了控制細(xì)胞命運(yùn)之路的開關(guān)。
在這項(xiàng)研究中,第一作者彭懿蓉博士與其同事關(guān)注的神經(jīng)細(xì)胞,外觀也仿佛綻放的煙花,被神經(jīng)科學(xué)家命名為“星爆(starburst)無長(zhǎng)突細(xì)胞”(簡(jiǎn)稱SAC)。
同款花型的焰火,升空后可能在不同的高度盛開;而這種SAC細(xì)胞也會(huì)隨著視網(wǎng)膜的發(fā)育,從出生地遷移到細(xì)胞層的不同位置。不過,生命的安排要更加有序,細(xì)胞的位置、結(jié)構(gòu)和功能環(huán)環(huán)相扣。一對(duì)SAC細(xì)胞遷移到相鄰的細(xì)胞層,加入神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),分別響應(yīng)增強(qiáng)的光照(ON型)和減弱的光照(OFF型)。然而,除了相對(duì)位置的不同,過去的方法幾乎無法區(qū)分它們。因而自20世紀(jì)70年代發(fā)現(xiàn)SAC以來,它們一直被認(rèn)為是一對(duì)同類型細(xì)胞。
▲小鼠視網(wǎng)膜中的ON和OFF型星爆無長(zhǎng)突細(xì)胞(SAC)(圖片來源:Yi-Rong Peng)
這支研究團(tuán)隊(duì)的主要負(fù)責(zé)人之一是知名神經(jīng)科學(xué)家Joshua R. Sanes教授,他在視網(wǎng)膜細(xì)胞的研究上做出了大量突破性工作。就在今年早些時(shí)候,這支團(tuán)隊(duì)利用一種叫作高通量單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)的技術(shù),首次創(chuàng)建了靈長(zhǎng)類動(dòng)物視網(wǎng)膜細(xì)胞的型態(tài)分類圖譜。學(xué)術(shù)經(jīng)緯團(tuán)隊(duì)此前也和讀者介紹過這項(xiàng)榮登《細(xì)胞》封面的工作。
那么,這種新技術(shù)還可以為成對(duì)細(xì)胞的差異提供更多的線索嗎?此次研究給出了漂亮的答案。
為了找出ON型SAC和OFF型SAC的分子差異,彭懿蓉博士和同事們對(duì)不同發(fā)育時(shí)期的共2000多個(gè)SAC細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq分析,并按照基因表達(dá)的差異把它們分成兩組,并且確定,基因表達(dá)譜不同的兩類就是相應(yīng)的ON/OFF類型。
▲從胚胎期到出生后,SAC在視網(wǎng)膜中的發(fā)育變化示意圖(圖片來源:參考資料[1])
如何從這些差異表達(dá)的基因中找到?jīng)Q定不同命運(yùn)的關(guān)鍵基因呢?研究人員推斷,轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控其他基因的表達(dá),可以控制細(xì)胞的發(fā)育程序,而如果在發(fā)育早期某個(gè)轉(zhuǎn)錄因子只存在于其中一組細(xì)胞,那么很可能是引導(dǎo)細(xì)胞走向最終命運(yùn)的關(guān)鍵。于是,研究人員重點(diǎn)尋找符合這種條件的轉(zhuǎn)錄因子。
他們找到了第一個(gè)目標(biāo):Fezf1。在SAC前體細(xì)胞結(jié)束有絲分裂后的早期SAC細(xì)胞中,有一半細(xì)胞表達(dá)這個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。而到發(fā)育后期,表達(dá)Fezf1的那一半遷移到相對(duì)靠近內(nèi)緣的位置,成為ON型;相反,缺少Fezf1的那一半細(xì)胞,留在相對(duì)外緣的位置,成為OFF型。
▲Fezf1是決定SAC命運(yùn)的關(guān)鍵(圖片來源:參考資料[1])
隨后的一組實(shí)驗(yàn)確認(rèn),F(xiàn)ezf1正是控制SAC成為ON型還是OFF型的命運(yùn)開關(guān)!當(dāng)研究人員把它從ON型細(xì)胞中移除,這些細(xì)胞變成了OFF型;而把它放入OFF型細(xì)胞,那些細(xì)胞變成了ON型。“這種轉(zhuǎn)變不單單是ON/OFF位置的變化,而且是ON/OFF基因表達(dá)譜的完全反轉(zhuǎn)。”彭博士說。
那么,在轉(zhuǎn)錄因子Fezf1調(diào)控的各種基因中,是否存在下游基因?qū)iT負(fù)責(zé)使ON和OFF型細(xì)胞遷移到不同的位置?研究小組回到scRNA-seq的數(shù)據(jù),進(jìn)一步找到了另一個(gè)基因Rnd3。而它作為Fezf1控制下游程序的一部分,控制不同SAC的遷移。
▲Rnd3作為Fezf的下游控制SAC(圖片來源:參考資料[1])
綜合這些結(jié)果,研究作者以視網(wǎng)膜的SAC為例,大海撈針式地梳理出一套基因程序,揭示了一對(duì)相似的細(xì)胞如何走向不同命運(yùn)的過程。而在我們的體內(nèi),還有很多其他類型的神經(jīng)元,研究者希望,這種方法同樣可以有效地找出決定其他神經(jīng)元結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)鍵“開關(guān)”,為理解生命的奇妙提供洞見。
參考資料
[1] Yi-Rong Peng et al., (2019) Binary Fate Choice between Closely Related Interneuronal Types Is Determined by a Fezf1-Dependent Postmitotic Transcriptional Switch. Neuron. DOI: https://doi.org/10.1016/j.neuron.2019.11.002
原標(biāo)題:Neuron:在小徑分岔的視網(wǎng)膜,尋找到?jīng)Q定命運(yùn)的開關(guān)
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