PROTACs全稱為Proteolysis-Targeting Chimeras,即蛋白水解靶向嵌合體,其結(jié)構(gòu)看起來像啞鈴一樣,通過一個(gè)“連接器“(linker)連接“興趣蛋白的配體”以及“E3泛素連接酶的招募配體”。也就是說,PROTACs分子的一端與興趣蛋白(即靶蛋白)結(jié)合,另一端與E3泛素連接酶結(jié)合。而E3泛素連接酶可通過將一種叫做泛素的小蛋白貼在靶蛋白上將其標(biāo)記為缺陷或受損蛋白。之后,細(xì)胞的蛋白粉碎機(jī)(即,蛋白酶體)會(huì)降解被標(biāo)記的靶蛋白。
PROTACs作用方式示意圖(來源:Royal Society of Chemistry)
2019年3月,Nature曾發(fā)文稱,基于PROTACs技術(shù)的蛋白降解劑可能將成為下一類重磅藥物。近兩年,在學(xué)術(shù)領(lǐng)域,與PROTACs相關(guān)的研究成果頻出;在產(chǎn)業(yè)領(lǐng)域,基于該技術(shù)的藥物研發(fā)儼然已經(jīng)成為新熱門,從初創(chuàng)公司到制藥巨頭,都難掩對(duì)PROTACs的熱情。更值得一提的是,隨著全球首個(gè)基于PROTACs開發(fā)的小分子蛋白降解劑ARV-110披露積極的I期臨床數(shù)據(jù),業(yè)界對(duì)該技術(shù)臨床轉(zhuǎn)化的信心大大增加。
來源:Royal Society of Chemistry
近日,由PROTACs技術(shù)先驅(qū)耶魯大學(xué)Craig Crews教授和楊森制藥的科學(xué)家Hilmar Weinmann主編的題為“Protein Degradation with New Chemical Modalities: Successful Strategies in Drug Discovery and Chemical Biology”的專著正式發(fā)表。該書共15章節(jié),359頁,全面概述了該領(lǐng)域領(lǐng)先的科學(xué)家最近的研究進(jìn)展以及該領(lǐng)域目前面臨的一些挑戰(zhàn)。
推薦語中寫道:利用小分子靶向降解蛋白質(zhì)是幾十年來最令人興奮的小分子治療策略之一,也是一個(gè)快速發(fā)展的研究領(lǐng)域。特別是,PROTACs的發(fā)展為解決傳統(tǒng)上難以靶向的蛋白質(zhì)開辟了新的途徑。對(duì)于藥物研發(fā)和化學(xué)生物學(xué)領(lǐng)域的研究人員來說,這本書會(huì)是一本理想的參會(huì)書。
在可免費(fèi)閱讀的第一章中,Craig Crews教授、Hilmar Weinmann以及拜耳的科學(xué)家Philipp M. Cromm回顧了PROTACs的發(fā)展歷程,討論了PROTACs的優(yōu)化,以及該技術(shù)介導(dǎo)的靶向降解能否改變藥物研發(fā)的范式。
文章指出,自2001年第一篇概念驗(yàn)證研究發(fā)表,到2019年P(guān)ROTACs首次進(jìn)入臨床試驗(yàn),該技術(shù)已經(jīng)發(fā)展為一種化學(xué)生物學(xué)方法和新的治療方式。
在技術(shù)發(fā)展早期,PROTACs的E3鏈接酶結(jié)合基序是肽,導(dǎo)致PROTACs的細(xì)胞通透性有限,降解效果差。而隨著科學(xué)家們開發(fā)出更具藥樣(drug-like)特性的VHL E3連接酶擬肽配體以及對(duì)沙利度胺作用模式的闡明(這類藥物可重定向E3泛素連接酶CRBN,從而使轉(zhuǎn)錄因子IKZF1和IKZF3多聚泛素化,導(dǎo)致IKZF1和IKZF3被蛋白酶體降解),PROTACs技術(shù)取得了突破性進(jìn)展。這些發(fā)現(xiàn)也為2015年報(bào)道的靶向RIPK2/ERRα12和BRD4的首批藥物樣PROTACs的開發(fā)鋪平了道路。由于這些開創(chuàng)性的研究極大地加速了該領(lǐng)域的發(fā)展,學(xué)術(shù)界和工業(yè)界對(duì)PROTACs誘導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解的興趣大大增加。從那時(shí)起,許多研究小組就專注于探索這項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)、機(jī)會(huì)、局限和弱點(diǎn)。
PROTACs發(fā)展時(shí)間線(來源:Royal Society of Chemistry)
為了將基于PROTACs技術(shù)的蛋白降解劑推向臨床,Crews教授在2013年成立了Arvinas。之后,C4 Therapeutics(2015年)、Kymera Therapeutics(2017年)相繼成立,致力于探索小分子蛋白降解劑的治療潛力。目前,這3家公司均已與多家大型制藥公司達(dá)成合作。而事實(shí)上,無論是與初創(chuàng)公司合作,還是自己設(shè)立蛋白降解部門,幾乎每一家制藥公司都已開始評(píng)估PROTACs技術(shù),如諾華、阿斯利康、GSK。
目前,項(xiàng)目進(jìn)展最快的是Arvinas。該公司在2019年率先開始了兩項(xiàng)臨床試驗(yàn),一項(xiàng)在轉(zhuǎn)移性去勢(shì)抵抗性前列腺癌(mCRPC)患者中調(diào)查靶向雄激素受體(AR)的小分子蛋白降解劑ARV-110,另一項(xiàng)在轉(zhuǎn)移性ER+陽性/HER2陰性乳腺癌患者中調(diào)查靶向雌激素受體(ER)的小分子蛋白降解劑ARV-471。
在靶點(diǎn)選擇方面,除了前文提到的AR、ER、BRD4等靶點(diǎn),自2001年以來,已有大量的蛋白成為PROTACs領(lǐng)域研究者的選擇。下表按時(shí)間順序,對(duì)大部分已被報(bào)道的PROTACs靶點(diǎn)以及相應(yīng)的E3連接酶進(jìn)行了總結(jié)。
表1 部分通過PROTACs泛素化途徑被成功降解的蛋白質(zhì)
來源:Royal Society of Chemistry
相比傳統(tǒng)的蛋白抑制劑,基于PROTACs的蛋白降解劑有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。比如,對(duì)粘附斑激酶(FAK)來說,PROTACs誘導(dǎo)的靶向降解能夠關(guān)閉FAK的支架功能,這是小分子FAK抑制劑無法實(shí)現(xiàn)的。靶向SMARCA2/4的PROTACs也展示了同樣的優(yōu)勢(shì),SMARCA2/4是BAF復(fù)合物的一部分,出了名的難靶向。此外,也有研究報(bào)道,Tau降解劑可清除額顳葉癡呆(FTD)患者來源的神經(jīng)元細(xì)胞模型中的累積蛋白,將PROTACs的潛在治療領(lǐng)域擴(kuò)大到了神經(jīng)退行性疾病。這些研究均證明,PROTACs具有擴(kuò)大可靶向蛋白種類的巨大潛力。
到目前為止,蛋白降解劑的研究主要集中在腫瘤領(lǐng)域,并在神經(jīng)退行性疾病、炎癥/免疫學(xué)領(lǐng)域有所發(fā)現(xiàn)。盡管還有很多挑戰(zhàn)和障礙需要克服,但迄今為止取得的初步成功預(yù)示著PROTACs的光明未來。三位作者表示,接下來,PROTACs誘導(dǎo)的蛋白降解將解決哪些突出的難以處理的疾病驅(qū)動(dòng)因素,非常令人期待。
參考資料:
1# Protein Degradation with New Chemical Modalities: Successful Strategies in Drug Discovery and Chemical Biology(來源:Royal Society of Chemistry)
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